巴西安全部门也发起了最后的冲锋。在双方的共同努力下，日本精英小队被全部歼灭，松本健一也被本田惠子生擒。
这场渗透与反渗透的战斗终于落下了帷幕。巴西政府对松本健一进行了公开审判，他的罪行被一一揭露。那些与他有勾结的政客也受到了相应的惩罚。
日本国内的组织在得知松本健一失败后，也停止了在巴西的渗透计划。
本田惠子和她的抵抗团体成为了巴西的英雄，他们的事迹被广为传颂。日本裔社区也因为这件事更加融入巴西社会，他们明白了在巴西这片土地上，要遵守巴西的法律，与巴西人民共同发展，而不是被别有用心的人利用去做危害巴西的事情。
巴西在经历了这场危机后，也加强了对外国势力《渗透者》最终结局
松本健一被审判后，被判处终身监禁，他将在巴西的监狱里度过余生，为他妄图渗透巴西、危害巴西国家安全的罪行付出沉重的代价。
本田惠子和她的抵抗团体在事件结束后并没有因此而松懈。他们深知，这次虽然成功挫败了日本方面的渗透阴谋，但巴西在国际舞台上的特殊地位必然会引来其他潜在的威胁。他们积极投身于社区与巴西本土的融合工作，倡导日本裔巴西人积极参与巴西的社会建设、政治事务以及国家安全防范工作。
在日本裔社区内，经历了这次事件后发生了深刻的变化。曾经被松本健一利用的文化交流中心被重新改造，变成了真正促进日巴文化交流、增进两国人民友谊的场所。社区内开设了许多课程，教导年轻一代如何辨别和抵制不良的外部势力渗透，同时也积极宣传巴西的多元文化和包容精神，让在巴西出生成长的日本裔更加深入地了解他们生活的这片土地的价值观。
巴西政府在这次事件后进行了全面的反思。他们加大了对外国投资和文化交流活动的审查力度，尤其是在涉及国家安全的关键领域，如军事相关产业、粮食资源和重要基础设施等。同时，政府还投入大量资源用于培训安全部门的特工，提高他们应对国际渗透威胁的能力，并且加强了与其他国家在反间谍、反渗透方面的情报共享与合作。
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